故事从墓地开始,霍雷肖·凯恩在教堂里向神父忏悔,地表爆发出阵阵枪声...虽然案子破了,但这也为这个赛季的结束做了铺垫。这一季增加了一些CSIer的故事。埃里克·德科卷入大麻事件,受到外事部门的询问和访问。雷恩·沃夫在一次调查访问中被针刺伤了眼睛,影响了视力。因为他的使命,霍雷肖·凯恩认识了埃里克的妹妹玛丽,并最终结婚了。这一季的主线是实验室里出现了外敌,谁是外敌也让实验室里的人感到不安,这个外敌会在第25集出现。剩下的25集也为下一季做了展示,因为第一集出现的黑帮袭击了霍雷肖并枪杀了他的妻子。由于联邦调查局的参与,帮派成员被带到巴西,霍雷肖和埃里克决定跟踪他,以便将他绳之以法。